+90 (212) 358-1540 x7284
birgul@boun.edu.tr

Anasayfa | Özgeçmiş | Yayınlar | Dersler | Web Sayfası

Araştırma:

Kanser hücrelerinde aktif rol oynayan Wnt/beta-katenin yolağında anlatımı etkilenen genlerin karakterizasyonu

Wnt/beta-katenin yolağı omurgalı ve omurgasızlarda embriyonal gelişiminde düzenleyici görevindedir. Wnt bir glikoprotein olup frizzled transmembran reseptörüne bağlanmaktadır, beta-katenin ise çok fonksiyonlu adaptör proteini veya transkripsiyon faktörü olup birçok kanserde düzensizdir. Wnt'in reseptöre bağlanmaması halinde beta-katenin hücre sitoplazmasında degredasyon kompleksi Glycogen Synthase Kinase3 (GSK-3), Casein kinase (CK1), Axin, Adenomatous Polyposis Coli (APS) ve Protein Serine/Threonin Phosphatases2A (PP2A) tarafından fosforile edilip degrede edildiği için düşük miktarda bulunmaktadır. Wnt'in reseptöre bağlanması halinde Dishevelled (Dsh) proteini aktif hale geçip GSK-3 degredasyon kompleksinden uzak tutmaktadır. Böylece beta-katenin fosforlanmayıp, degrede olmamakdadır. Bu durumda beta-katenin hücre çekirdeğine taşınıp LEF/TCF (Lymphoid enhancer factor/ternary complex factor) ile bir kompleks oluşturup transkripsiyon faktörü olarak görev almaktadır. Bu yolak üzerindeki birçok molekül çeşitli tümör oluşumlarıyla ilişkilendirilmiştir. Özellikle beta-katenin proteininin birikimi çeşitli kanser (hepatoselüler ve kolon kanserleri gibi) vakalarında gözlemlenmiştir. Bu kanser türlerinde, beta-katenin artışına bağli olarak birçok hedef genin aktivasyonu veya inhibisyonu söz konusudur. Bu hedef genlerde toplu bir tanım yapılması amacıyla grubumuzca gerçekleştirilen SAGE çalışmasında, S33Y-beta-kateninin anlatım sonucu farklı anlatımları oluştuğu gözlenen genler belirlenmiştir. Biyoinformatik yöntemlerle hedef genler belirlenip sınıflandırılmıştır. Bu hedef genlerin detaylı analizi için çeşitli in vitro (Q-RT-PCR, Koloni formasyonu, proliferasyon vs.) ve in vivo (overekspresyon deneyleri gibi) yöntemler kullanılmaktadır. Detaylı bilgi için web sitemize girin Aklab.boun.edu.tr